Desinstale todos os itens correspondentes ao SQL, depois reinicie o computador e vá no painel de controle > adicionar/remover programas, daí você desinstala todos os itens correspondentes ao SQL lá também. Após ter feito todo esse processo, reinicie o computador novamente e tente efetuar a instalação again.
De preferência, baixe outro SQL 2008 R2 (o completo de 4 GB). (esse: