Olha, tem jeito sim, sobre os comentários acima... eu discordo em parte, pois rankingserver, dataserver, joinserver, eventserver... entre outros, na maioria das vezes n afetam em nada ao mudar o gameserver (A não ser que seja arquivos de um MS de versão diferente, como ja citaram acima ou programas que sejam usados para o funcionamento exclusivo de um certo gs, um exemplo disso é o caso do SCFdb: usado em MuServer's da SCFTeam)... Resumindo..
Vc só vai precisar manter a pasta Data e a pasta do GameServer e se for o caso, GameServerCS de restante pode trocar tudo... Lembrando, se for para um MS de mesma versão